Wegen ihrer anti-inflammatorischen Effekte und ihrer Potenz, die Synthese der meisten Zytokine und die Balance Th1/Th2 zu beeinflussen, tragen die endogenen Glukokortikoide zur basalen Regulation der Immunzellen bei. Immunologische Prozesse verursachen die Produktion von Zytokinen, wie IL-1, IL-2, IL-6, IL-11, IL-12, TNF-α, INF-γ, welche ihrerseits die HPA Achse stimulieren können. Der dadurch vermittelte Anstieg von Glukokortikoiden wirkt entweder direkt oder über die Beeinflussung der Produktion von Zytokinen auf immunologische Zellen, was die Existenz eines zytokinvermittelten immunregulatorischen Regelkreises mit der HPA Achse nahelegt. Es gilt als gesichert, dass dieser Regelkreis eine bedeutsame Rolle spielt bei der Kontrolle einer überschießenden Immunantwort und der Unterdrückung der Expansion von Immunzellen mit fehlender oder nur geringer Affinität zu Antigenen, welche die spezifische Immunantwort auslösen.