A study of the recent sedimentation of the ria de Gernika (Bay of Biscay) is undertaken to characterise different steps of its Holocene filling. Sedimentological and micropalaeontological analysis of six cores sampled in the ria, completed with absolute dating ( 1 4 C, and based upon 2 1 0 Pb exc.), allow us to identify three phases in the filling of the ria that are limited by two transgressive shifts (3500 and 2500 yr. B.P.) already described in other areas of the Bay of Biscay. In the first phase, lithologies as well as benthic foraminifera and ostracode assemblages are typical of coastal marine palaeo-environment. During the second phase the euryhaline waters progessively occupy the central area of the estuary. Here the presence of allochthonous microfauna, particularly of planktonic foraminifera, indicates an increase of exchanges with marine waters that can reach the inner areas of the estuarine system. The last phase (2500 yr. B.P. to the present), which corresponds to the recent and active sedimentation, is marked by an impoverishment of the microfaunas, the filling of some channels and the increase of salt marshes. The estimated sedimentation rate for the upper decimetres of the cores (0.73-1.29 cm.yr - 1 ) shows faster sedimentary filling of the ria with anthropic action evidenced by the presence of metallic contaminants and hypohaline microfauna.Une etude de la sedimentation recente de la ria de Gernika (golfe de Gascogne) est entreprise dans le but de determiner les diverses etapes de son comblement holocene. L'analyse sedimentologique et micropaleontologique de six carottes prelevees dans la ria, completee par des datations absolues ( 1 4 C) et l'estimation de taux de sedimentation basees sur la mesure du 2 1 0 Pb exc. permettent d'identifier trois episodes dans le comblement de la ria qui correspondraient a deux pulsations transgressives (3500 et 2500 ans B.P.) deja observees dans d'autres secteurs du golfe de Gascogne. Dans le premier episode, les lithologies et les associations de foraminiferes benthiques et d'ostracodes montrent un paleoenvironnement marin cotier. Dans le second episode, les paleoenvironnements euryhalins gagnent progressivement la partie mediane de l'estuaire avec, au meme moment, la presence de microfaunes allochtones (foraminiferes planctoniques surtout) qui suggere une augmentation des echanges avec les eaux marines jusque dans la partie la plus amont du systeme. L'episode 3 (2500 ans B.P. a l'actuel) correspond a une sedimentation recente toujours active; elle se traduit par un appauvrissement de la microfaune, un colmatage des chenaux et une extension de la zone de schorre. Les taux de sedimentation dans les derniers decimetres (0.73-1,29 cm/an) temoignent d'une acceleration du comblement de la ria durant le dernier siecle au cours duquel l'action anthropique se manifeste par la presence de contaminants metalliques (Pb et As) et d'une faune hyposaline.