Human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase (HIV1 RT) is essential for virus replication. After cell infection, RT catalyses the synthesis of the proviral genome, which is then integrated into the host cell genome. The present understanding of the origin of viral genetic information variations following provirus synthesis is summarized here. During reverse transcription, the structures of the primer-template nucleic acid duplex (A, A-like and B forms), and the local helix bends, modulate RT DNA polymerizing activity by acting on kinetic parameters of nucleotide incorporation and on enzyme processivity. Moreover, the cellular microenvironment, such as dNTP pool imbalance, is involved in mutation fixation by directly influencing RT activity and viral mutation rates. In addition to genome variations linked to RT activity, other parameters, like permanent viral replication and compartmentalization, contribute to HIV1 variability. The implications of these findings on therapy directed against HIV1 infection are discussed.La transcriptase inverse (RT : reverse transcriptase) du VIH1 (virus de l'immunodeficience humaine de type 1) est une enzyme essentielle pour la replication virale. Apres infection de la cellule, la RT catalyse la synthese du genome proviral, lequel est alors integre au sein du genome de la cellule hote.Au cours de la retrotranscription, les structures des acides nucleiques doubles brins matrice-amorce (sous les formes A, A-like et B) ainsi que les courbures locales des helices, modulent l'activite ADN polymerase de la RT en agissant sur les parametres cinetiques d'incorporation nucleotidique ainsi que sur la processivite de l'enzyme. La fluctuation du microenvironnement cellulaire, comme un desequilibre dans la concentration relative en dNTPs, est impliquee dans la fixation et les taux des mutations en modulant directement l'activite de la RT. En plus des variations du genome liees a l'activite de la RT, d'autres parametres, comme la replication virale permanente et la compartimentation de l'infection virale contribuent a la variabilite du VIH1. Les implications de ces phenomenes sur la therapie dirigee contre l'infection par le VIH1 sont discutees.