L’identification au laboratoire des infections fongiques à levures doit être rapide, fiable et capable de détecter des infections mixtes avec des espèces montrant un profil de résistance aux antifongiques différent. Ainsi, nous réalisons en routine une recherche par culture sur milieu chromogène couplée à une identification des souches par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF, soit un résultat préliminaire entre 36 et 48h et un résultat définitif 4jours après réception du prélèvement. Et si la spectrométrie de masse nous permettait, dans certains cas, de diminuer ce temps d’analyse, y compris en cas de culture mixte ?Nous avons construit une application WEB afin de permettre une identification rapide en ligne de spectres de masse issus de champignons et avons incrémenté ce système par diverses fonctionnalités dont une permet de vérifier la pureté des échantillons en identifiant des spectres composés de deux spectres d’espèces différentes. Une ré-analyse des résultats obtenus d’avril 2012 à avril 2013 dans notre laboratoire a montré que sur 5671 prélèvements positifs de patients, 498 (8,78 %) étaient contaminés par au moins deux espèces de levures. Nous avons sélectionné 225 spectres de masse qui correspondaient à la primo-culture d’une partie de ces 498 échantillons et nous les avons soumis à la fonctionnalité de recherche de mélanges de notre application WEB.Pour 42 souches (18 %), nous avons pu mettre en évidence un mélange. Dans 5 cas, une des espèces identifiée dans le mélange n’était pas celle que nous avons retrouvée sur milieu chromogène (espèce minoritaire qui a échappé à la remise en culture ?). Pour les 37 autres cas, l’application WEB a montré la présence, sur une colonie supposée isolée, d’un mélange de spectres appartenant aux espèces isolées plus tard sur milieu chromogène.Ce travail nous laisse entrevoir les possibilités qu’il y aurait à mieux étudier mathématiquement les spectres, en particulier pour mettre en évidence des spectres mixtes, témoins de l’infection d’un patient par plusieurs espèces fongiques différentes. Par ailleurs, le spectre de masse est une donnée numérique qui ne s’altère pas avec le temps et qui nous permet de réaliser des analyses de qualité a posteriori. Que va-t-on découvrir en faisant de la spectro-archéologie ?