Le caspasi, una famiglia di proteasi della cisteina, sono i principali mediatori dell'apoptosi e dell'infiammazione. La caspasi-6 è classificata come effettore apoptotico e media il restringimento nucleare durante l'apoptosi, ma possiede meccanismi di attivazione e regolazione unici che differiscono da quelli di altre caspasi effettrici. Inoltre, crescenti prove hanno dimostrato che la caspasi-6 è altamente coinvolta nella degenerazione degli assoni e nelle malattie neurodegenerative, come la malattia di Huntington e il morbo di Alzheimer.